Souvent ces deux régions sont regroupées par commodité même si elles n’ont en commun que le fait d’avoir des cépages originaux et de produire des vins d’un style particulier.

Dans le Jura, on compte actuellement environ 1850 ha de vignes répartis sur 4 zones géographiques : Arbois, Côtes du Jura, l’Etoile et Château Chalon.
La notoriété des vins du Jura s’appuie sur une image forte du terroir et sur la préservation de pratiques œnologiques et culturales traditionnelles.
La diversité est sans doute ce qui caractérise le mieux le vignoble jurassien : 5 cépages (chardonnay et savagnin pour les blancs, pinot noir, poulsard et trousseau pour les rouges), 6 AOP, vins tranquilles (blanc, rouge, rosé, jaune), vins effervescents (crémant du Jura), vins liquoreux (vins de paille), vins de liqueur (Macvin du Jura).

Le vignoble de Savoie s’étend sur environ 2200 ha et 4 départements : Savoie (80% de la production), Haute Savoie, Ain et Isère.
On y dénombre 22 Appellations d’origine protégée. Les 2 tiers de la production sont des vins blancs.
Il s’agit d’un vignoble planté à faible altitude (majoritairement entre 250 et 500 mètres d’altitude) et très morcelé.
A cause d’une forte pluviométrie et d’une température annuelle moyenne peu élevée, les vignerons recherchent les parcelles les mieux exposées.